В работе проводится исследование контроллинга как экономической категории, оценка применяемого инструментария и связи с системой управленческого учета. Исследованы информационные возможности учетных систем с позиции применения системы контроллинга, описаны методики формирования управленческой отчетности сельскохозяйственных компаний, а также регламенты процессов компании. В рамках совершенствования системы контроллинга представлены авторская концепция контроллинга, а также описание системы бизнес-моделирования, рассмотрена система управления проектами.